В 1992 годупри содействии Министерства образования, ГУО, и других юридических и физических лиц была создана первая и единственная в Республике Бурятия частная общественно-государственная школа-центр гуманитарных инноваций «Байкальская перспектива».Это была первая частная школа с общественно-государственным управлением в Республике Бурятия и первая школа, в которой был создан Попечительский совет.
01.09.1999г. – школа получила статус Муниципального учреждения образования;
01.11.2000г. – реорганизация школьного Попечительского совета в юридическое лицо «Городская общественная организация «Попечительский совет школы «Байкальская перспектива»;
01.09.2001г.– реорганизация в основную общеобразовательную школу;
14.03.2008г. – переименование в основную общеобразовательную школу № 21 «Байкальская перспектива»;
2001г.–школе был присвоен статус Федеральной экспериментальной площадки по теме «Экспериментальная программа развития новых форм Российского образования в современных социально-экономических условиях на базе школы»;
2003г. – школе присвоен «Знак качества образования»;
2005г. – диплом лауреата конкурса «Школа года»;
2006г. – участник конкурса «Муниципальных образовательных учреждений, активно внедряющих инновационные образовательные программы» в рамках реализации национального проекта «Поддержка школ, активно внедряющих инновационные образовательные программы», по результатам которого учреждению присвоена поощрительная премия президента РБ в размере 300 тысяч рублей;
2007г. – участие и победа в первом Республиканском конкурсе среди общеобразовательных учреждений, вступающих в эксперимент по введению новой системы оплаты труда педагогических работников;
2011г. – переход в автономное общеобразовательное учреждение
2012г. – открытие 10 класса
2013г. – реорганизация в среднюю общеобразовательную школу